R Markdownを使用したBibTeXによる参考文献管理 — 簡単ガイド

R Markdownは、再現可能なレポート、論文、プレゼンテーションなどを作成するための優れたツールです。R Markdownが非常に強力なのは、他のツールやソフトウェアと統合できる能力です。その一つがBibTeXで、これはLaTeX文書のための参考文献管理システムです。BibTeXを使用することで、文書内で簡単に情報を引用し、参考文献リストを作成できます。

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ステップ1: .bibファイルを作成し、エントリを追加する

前のセクションと同様に、bibliography.bibという名前の.bibファイルを生成し、その後BibTeXエントリを追加します。 BibTeXエントリは以下の形式で構成されており、それぞれの文献ソース（本、エッセイなど）の引用と参考文献への挿入に必要な情報が含まれています。

前のセクションの例を使用して、アーネスト・ヘミングウェイの本『老人と海』を引用します。エントリは次のようになります：

@book{Hemingway1952,
  title={The Old Man and the Sea},
  author={Hemingway, Ernest},
  year={1952},
  publisher={Charles Scribner's Sons}
}

再度、このエントリの「解剖学」を分解し、各BibTeXエントリがどのように定義されているかを理解するために3つの要素を見ていきます：

• エントリタイプ: @bookで、参照のスキーマ@typeに従ってタイプを定義します。科学論文用の@articleなど、様々なタイプがあります。BibTeXは、どのフィールドがオプションで、どれが必須であるかを正しく指定することを好みます。
• エントリフィールド: @bookの例では、これらはtitle、author、year、publisherです。（Cf. fields）
• 引用キー: この例ではHemingway1952で、LaTeXの中で引用を示すために使用されます。R Markdownではこれを[@Hemingway1952]で行います。引用キーは任意の文字列であり、著者、年、およびタイトルの単語の組み合わせであることがよくあります。

ステップ2: R Markdownドキュメントを作成し接続する

R MarkdownとBibTeXを統合するのは非常に簡単です。YAMLでbibliography: bibliography.bibを指定し、インテキスト引用を配置したい場所に[@Hemingway1952]を記述するだけです。

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title: "R MarkdownにおけるBibTeX参考文献"
author: "John Doe"
date: '2022-07-19'
bibliography: bibliography.bib
output: html_document
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## R MarkdownにおけるBibTeX参考文献

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Praesent enim urna, dapibus et bibendum vel, consectetur et turpis.
Cras a molestie nulla. [@Hemingway1952]

参考文献管理ツール

手動でBibTeXファイルをフォーマットするのは面倒な場合が多いため、参考文献管理ツールを使用することが一般的に推奨されます。以下は、この目的に適したいくつかのツールです：

• CiteDriveは、プロジェクト内での参考文献とチームを管理するための、BibTeXに基づいた共同作業型のクラウドベースのツールです。Overleafへのワンクリックエクスポートを提供します（Cf. Overleaf Blog Post - https://www.overleaf.com/blog/citedrive… | CiteDrive-Overleaf用の簡単な参考文献管理)とR Markdown（Cf. Medium post: CiteDriveとRStudioを使用したR Markdownにおける参考文献管理）に対応しており、引用を同期したまま保ちます。
• Zoteroは、文献データと関連研究資料（PDFファイルなど）を管理するための無料でオープンソースの文献管理ツールです。ZoteroでのBibTeXの最高のパフォーマンスは、**Better BibTeX For Zotero**を使用することで実現されます。
• 無料のオープンソースソフトウェアであるJabRefは、Windows、Mac、Linuxで動作するBibTeX対応の参考文献管理ツールです。Javaに基づいており、JabRef e.V.によって維持されています。