Referenshantering med BibTeX i R Markdown -- En kort guide

R Markdown är ett kraftfullt verktyg för att skapa reproducerbara rapporter, artiklar, presentationer och mer. En av de funktioner som gör R Markdown så effektivt är dess förmåga att integrera med andra verktyg och programvara. Ett sådant verktyg är BibTeX, som är ett system för referenshantering för LaTeX-dokument. BibTeX gör det enkelt att citera källor i ditt dokument och skapa en bibliografi.

Behöver du en enkel lösning för att hantera dina BibTeX-poster? Upptäck CiteDrive!

Webbaserad, modern referenshantering
Samarbeta och dela med forskarkollegor
Integration med Overleaf
Omfattande stöd för BibTeX/BibLaTeX
Spara artiklar och webbplatser direkt från din webbläsare
Sök efter nya artiklar i en databas med tiotals miljoner referenser

Prova CiteDrive ► Titta på demo

Steg 1: Skapa en .bib-fil och lägg till några poster

Som i föregående avsnitt börjar vi med att skapa en .bib-fil, som bibliography.bib, och fylla den med BibTeX-poster. BibTeX-poster konstrueras i följande format och innehåller tillräcklig information för att citera och inkludera varje litteraturkälla (bok, artikel osv.) i bibliografin.

Vi använder exemplet från föregående avsnitt och citerar boken The Old Man and the Sea av Ernest Hemingway. Posten ser då ut så här:

@book{Hemingway1952,
  title={The Old Man and the Sea},
  author={Hemingway, Ernest},
  year={1952},
  publisher={Charles Scribner's Sons}
}

Vi bryter ner “anatomin” av denna post och tittar på tre komponenter för att förstå hur varje BibTeX-post definieras:

Posttyp: Med @book definierar vi typen enligt schemat @type för referensen. Möjliga typer är till exempel @article för vetenskapliga artiklar och andra. BibTeX specificerar vilka fält som är obligatoriska och vilka som är valfria för att korrekt indikera dem i litteraturen.
Postfält: I vårt exempel för @book är dessa title, author, year och publisher. (Se fält för mer information.)
Citeringsnyckel: I vårt exempel är det Hemingway1952 och används för att ange en in-text citation i LaTeX, det vill säga för att referera till källan. I R Markdown gör vi detta med [@Hemingway1952]. Citeringsnyckeln kan vara vilken sträng som helst – ofta en kombination av författare, år och ett ord från titeln.

Steg 2: Skapa ett R Markdown-dokument och anslut

Att integrera BibTeX med R Markdown är väldigt enkelt. Du behöver bara specificera .bib-filen i YAML och citera med [@Hemingway1952] där du vill placera in-text citationen.

Här är ett exempel på ett R Markdown-dokument:

---
title: "BibTeX-referenser i R Markdown"
author: "John Doe"
date: '2022-07-19'
bibliography: bibliography.bib
output: html_document
---

## BibTeX-referenser i R Markdown

Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipiscing elit.
Praesent enim urna, dapibus et bibendum vel, consectetur et turpis.
Cras a molestie nulla. [@Hemingway1952]

I det här exemplet kommer [@Hemingway1952] att ersättas med den korrekta citeringen i den slutliga dokumentet.

Referenshanterare

Att formatera BibTeX-filer för hand kan vara tidskrävande, därför rekommenderas det generellt att använda en referenshanterare. Här är några verktyg som fungerar bra med BibTeX:

CiteDrive är ett BibTeX-baserat, samarbetsinriktat och molnbaserat verktyg för att hantera referenser och team i projekt. Det erbjuder en enkel export till Overleaf (Se Overleaf Bloggpost) och R Markdown (Se Medium-artikel), samtidigt som citeringar hålls synkroniserade.
Zotero är ett gratis, öppen källkod-program för hantering av litteratur som hanterar bibliografisk data och relaterat forskningsmaterial (t.ex. PDF-filer). Bästa BibTeX-prestanda i Zotero uppnås med Better BibTeX för Zotero-tillägget från retorque.
JabRef är en gratis, öppen källkod-programvara för referenshantering som stöder BibTeX och kan köras på Windows, Mac och Linux. Det är baserat på Java och underhålls av JabRef e.V.